蒙药学专业和药品生产技术专业实训室，由药用植物鉴定、生化分析、药物化学、药物制剂、蒙药炮制、蒙药药理、制剂检查、色谱分析实验、光谱分析实验、药物分析实验、动物标本陈列、腊叶标本陈列、蒙药标本等13个实验实训室组成。拥有光学显微镜、超临界流体设备、高效液相色谱仪、气相色谱仪、熔点测定仪、红外分光光度计、紫外分光光度计、旋转蒸发仪、合成装置等教学仪器设备共计300余万元。
实验实训室主要承担2个专业的蒙药学、蒙药鉴定学、蒙药方剂学、蒙药炮制学、药剂学、生物药物工艺学等专业课程的教学和科研课题任务，每年承担课程量300学时，实验开课率达到100%。
实验室现有实验教师共6人、实验技术人员1人，其中高级职称2人，研究生4人。实验实训指导教师们根据学科的培养目标和特点，合理制定实验教学计划和实验内容，在实验教学方面既注重学生的基本理论，更重视培养学生的综合能力、分析判断能力、科学思维能力。为提高学生的专业技能，实训室不断开展实验实训教学改革，定期开放实训室，鼓励学生到实训室开展实验。
